Иностранный гражданин с видом на жительство после подачи документов для регистрации в качестве ИП получил гражданство РФ

Добрый день.
Возникла неоднозначная ситуация. 
В феврале инстр.гражданин (есть вид на жительство) подавал документы через МФЦ на регистрацию ИП.
05.03.18, судя по сайту налоговой, он был зарегистрирован, но в МФЦ (за документами из регистрирующей МРИ) пригласили только на прошлой неделе. А этот человек уже успел сдать все свои документы, т.к. 06.04.18 получает гражданский паспорт РФ.  Не спрашивайте, почему он не мог подождать с регистрацией ИП, для меня самой загадка, и мне о грядущем получении гражданства он не говорил. 
Отдадут ли ему теперь в МФЦ документы о регистрации ИП  по гражданскому паспорту РФ??? 
Но главный вопрос: его снимут с регистрации в связи с аннулированием вида на жительство???? (его один раз уже снимали, когда кончился срок РВП, хотя у него уже был ВНЖ) Или можно какую-то форму подать в налоговую???